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jueves, 23 de julio de 2015

DISEÑO DE ESTRATEGIAS DE BIORREMEDIACIÓN BASADAS EN CONSORCIOS PLANTA-MICROORGANISMOS PARA RECUPERAR SUELOS CONTAMINADOS POR ACTIVIDAD MINERA EN ZAMORA-CHINCHIPE.

ABSTRACTO

Las micorrizas arbusculares (MA) son simbiontes benéficos para el crecimiento vegetal. Estos biótrofos, con la finalidad de crecer y  completar su ciclo de vida, deben mantener una asociación simbiótica estrecha con las raíces vivas de sus plantas huéspedes. Las plantas a cambio de este beneficio, obtienen mejoras significativas en cuanto a la absorción de nutrientes de  fósforo, la producción de hormonas de crecimiento, aumento de las proteínas, los lípidos y los niveles de azúcares, también ayuda a las plantas a que liguen mayor cantidad de metales pesados, toleren la salinidad, adquieran resistencia a enfermedades, e incluso ayudan en la absorción de radionúclidos. Las MA pueden interactuar simbióticamente con casi todas las plantas que viven en la Tierra. Se dice que se encuentran en las raíces de aproximadamente el 80-90% de todas las especies vegetales y sus cepas aisladas se pueden utilizar para la inoculación de especies de plantas que podrían ser utilizadas para la rehabilitación de sitios contaminados. En la provincia de Zamora Chinchipe, al sur del ecuador, dentro de los sectores Chinapintza y El Pangui, se ha reportado minería ilegal y no controlada, situación que ha puesto el suelo de tales localidades en situaciones deplorables. El objetivo principal de este estudio, fue primero poder hacer una secuenciación para obtener la caracterización molecular de las especies de MA (Filogenia), que se encuentran naturalmente sobre estos suelos ecológicamente contaminados (Micorrizorremediación). Por último, como parte de este mismo proyecto, otros dos estudios están siendo realizados paralelamente, con la finalidad de tratar de encontrar diversas soluciones para mejorar el suelo de este sector, tales objetivos secundarios son: medir la concentración de MA presente en las raíces de las plantas obtenidas en sitio contaminado y, crear una cosecha en invernadero con condiciones controladas, de plantas asociadas con hongos micorrizógenos inoculados artificialmente, utilizando suelo contaminado para determinar al analizar el tejido vegetal químicamente, si estas plántulas están logrando una mejora al absorber más metales pesados de lo normal. Los tres objetivos mencionados del estudio todavía se encuentran sin culminar y esperan ser publicados a fines de agosto 2015.


Introducción
El término "micorrizas" deriva literalmente de las palabras griegas myke y rhiza, que significan hongo y raíz, respectivamente (Wang y Qui, 2006). Según Jeffries et al. (2003) Quizás el mutualismo más extendido y ciertamente significativo entre las plantas y los hongos, es el de simbiosis de raíz, las mismas que tienen por nombre “micorrizas arbusculares” o sus siglas (MA). Los efectos beneficiosos de las MA resultan de la colonización micorrízica en las raíces, existe una mayor superficie de absorción y como consecuencia de una mayor área de suelo expuesto para sus plantas huéspedes, ayudan a estas a  absorber fósforo entre otros nutrientes esenciales de baja disponibilidad y a retenerlos mejor, ayudan también a promover el crecimiento hormonal e incrementar su contenido proteico, lipídico y de hidratos de carbono, como también en sus niveles de aminoácidos. (Selvaraj y Chellappan, 2006). Además de esto, las MA son consideradas componentes esenciales de la biota del suelo y además son conocidas por mejorar la tolerancia de las plantas frente a una amplia serie de posibles dificultades como son: la toxicidad de metales, salinidad y patógenos que podrían afectar a las plantas que viven dentro de un suelo infectado o contaminado (Olexa et al., 2000).

Como ya ha sido mencionado, los hongos MA, que están entre los componentes más comunes de suelo y en la flora de la rizosfera, son de gran interés para los científicos del suelo y del medio ambiente, en cuanto al tema de la fito remediación y el punto de vista ambiental. Las MA juegan un papel importante en la restauración de ecosistemas contaminados y se utilizan cada vez más en muchos países para mejorar la nutrición de las plantas y la fertilidad de las tierras degradadas. Como los MA se están convirtiendo disponibles en el mercado, su uso también ofrecerá nuevas vías para reducir la contaminación de la agricultura (Giasson et al., 2008).

La contaminación de la Biosfera por metales pesados ha acelerado dramáticamente durante las últimas décadas debido a la minería, la fundición, la fabricación, el tratamiento de los suelos agrícolas con agroquímicos, etc. (He et al., 2005). Un estudio realizado por Selvaraj et al. (2004) captó el efecto directo que tenían las esporas provenientes de un hongo MA en dos plantas, Phyllanthus niruri y Ecliptica alba, y reveló que las MA eran más beneficiosas para el crecimiento vegetal. Se observó que a pesar de la alteración del crecimiento, las plantas inoculadas y directamente asociadas con MA fueron eficientes respecto a tolerar ecosistemas en peligro. Las dos plantas hospedadoras inoculadas experimentales mostraron más captación de K + y Ca2 + en las raíces en comparación a la pobre captación de las plantas no inoculadas. De este modo, a través de la ayuda de los hongos MA, las probabilidades para sobrevivir para la vegetación son mayores en los ecosistemas perturbados de una gran manera.

METODOLOGIA

I: Caracterización molecular (Secuenciación, Filogenia) de las especies de MA provenientes de suelos ecológicamente contaminados.

Ø  Sitio de Estudio

Las muestras de suelo y de raíces fueron recolectadas en dos sectores: Chinapintza y El Pangui, ambos pertenecientes a Zamora Chinchipe, se sabe que el suelo de Chinapintza está contaminado por pequeñas actividades mineras, mientras que El Pangui que queda a 5Km de la de Chinapintza, es un sitio naturalmente contaminado.

Ø  Recolección de las Raíces

Se trabajó con 6 especies de plantas, de las cuales se recolectaron solo 3 réplicas por especie, en total 18 réplicas llevadas al laboratorio (cabe decir que es muy difícil recolectar plantas en un suelo tan contaminado). Estas 6 especies fueron: Erato polymnioides, Miconia sp, Medinilla sp, Axonopus compressus, Colocasia sp, Cyathea sp.

Ø  Análisis Molecular de las esporas encontradas en raíces con MA.

Se extrajo el ADN de las raíces de todas las muestras. Para obtener un producto de PCR  de MA, se utilizaron los primers AML1 y AML2. Este producto de PCR fue utilizado para el proceso de Clonning , en el cual se utilizó el vector PCR TOPO Zero BLUNT. Después de amplificar por medio del proceso de clonación, para poder confirmar estos productos de PCR, se tuvo que realizar un procedimiento de Check clonning.

El vector de PCR fue usado para check clonning y para secuenciación. Las colonias de bacterias del clonning fueron incubadas a 37° por 12 horas en una noche en Kanamicina.

Para la PCR del check clonning se utilizó los primers M13 foward y M13 reverse, esto fue para saber cuál de las colonias fueron las que sobrevivieron en kanamicina contenían el inserto, por ende, saber cuales son las que importan. Para esto se realizó una reacción de PCR y electroforesis para confirmación de estas. En la electroforesis, 800pb fue la altura del marcador para saber qué muestras eran los clones (positivos). Al final, de cada de las 18 répilicas de todas las raíces colectadas, se hizo unas 50 electroforesis totales. El sexto paso fue realizar una purificación del ADN. Finalmente se preparó un plato con las muestras que presentaron clones positivos para ser enviadas a secuenciar.

II: Medición de concentración de MA en las raíces de las plantas obtenidas.

Ø  Tinción de raíces para observar la colonización micorrízica.

Habiéndose colectado las raíces del sitio de muestreo, para entender y analizar el porcentaje de micorriza que estas raíces poseían, se utilizó la metodología de Philips y Hayman (1970), donde las raíces se las somete a un clareo y tinción.

Primero se lavaron las raíces para eliminar los residuos de tierra y se enjuagó con agua. Segundo, se sumergieron las raíces en KOH al 10% a 90°C por una hora o a 120°C por 15 minutos en autoclave. El tercer paso fue remover el KOH para enjuagar las raíces con agua algunas veces. El paso siguiente fue sumergir en agua oxigenada alcalinizada las raíces durante 10-30 porque todavía se encontraban pigmentadas. Enjuagamos nuevamente las raíces con agua normal. El penúltimo paso fue sumergir las raíces en HCL al 1% por cinco minutos y teñimos las raíces en una solución de glicerol ácido con azul de tripano a 90°C por toda la noche a 120 °C. Finalmente, el último paso fue descargar la solución colorante para mantener las raíces en agua a temperatura ambiente.

Fig 2. Proceso de identificación de esporas individuales a partir de MA aisladas.

III: Análisis de metales pesados por medio de tejido de raíces provenientes de cosecha en invernadero.

La una última parte de esta investigación, es enfocada a complementar el objetivo principal, al tratar de analizar si la condición del suelo contaminado puede mejorar gracias a la absorción de metales pesados por medio de plantas (semillas obtenidas de especies de Zamora Chinchipe), para esto, se debe inocular hongos micorrízicos (aislados) adentro de estas plántulas, y así, por medio de suelo obtenido del sitio original (Chinapintza), determinar si está surgiendo algún efecto positivo, y esto se realiza mediante un análisis químico de las raíces de estas plantas, luego que hayan transcurrido dos meses en cosecha en invernadero. Finalmente, se asesora cuál de las especies está absorbiendo más metales pesados con la ayuda de esta asociación micorrízica que fue colocada por ayuda nuestra.
Ø  Preparación de las masetas con distintos tipos de suelo.

Primero, se preparó 4 tipos distintos de masetas que contenían un distinto tipo de suelo cada uno, y en el cuál, cada tipo de suelo incluía sus 35 réplicas.





Fig 1. Diseño investigativo para el análisis de tejido vegetal. A cada tipo de maseta se le sembró semillas de Erato polymnioides. A.Suelo esterilizado, Control Positivo;  B—  Suelo no esterilizado, Control Negativo; CSuelo estéril con MA, Control positivo + MA; D Suelo no esterilizado, Control negativo + MA. Esta cosecha de plantas experimentales tuvo una duración de 2 meses.



Ø  Cosecha de semillas en invernadero.
Antes de sembrar las semillas, de los cuatro tipos de suelo separados, se autoclavó dos tipos de suelo en fundas, esto para estudiar las bacterias como una posible variable, ya que se sabe que su presencia a veces representa un problema.
Una vez obtenido cuatro tipos de suelo distintos (dos estériles y dos no estériles), se utilizó semillas de Erato polymnioides, provenientes del sector minero de Zamora Chinchipe, para ser sembradas en cada una de estos cuatro tipos de suelo. No necesariamente la inoculación de hongos MA se la realizaría en todos los tipos de suelo, sino en dos.

Ø  Método de Inoculación de MA bajo condiciones controladas.

Una vez, colocado los distintos tipos de suelo y las semillas en las masetas, se tuvo que adquirir hongos micorrízicos MA aislados. Se importó un tubo de MYKE® PRO Mycorrhizae. Estas son esporas aisladas de micorriza, y fueron aplicadas dentro de las masetas en solo dos tipos de suelo (suelo estéril y suelo no estéril), para una mejor explicación ver en la figura 1.  Al aplicarlas, se sabe que estas alianzan hongos en las plántulas y estimulan su crecimiento y desarrollo de la raíz, aumentando la tolerancia al estrés frente a metales pesados.


Fig 2. Proceso de identificación de esporas individuales a partir de MA aisladas.

Ø  Análisis químico de las raíces.

Luego de la siembra de las plantas experimentales en suelo contaminado, y después de un riego normal durante 60 días, crecieron unas pocas primeras plántulas, sobre todo las semillas que estaban en suelo esterilizado, más la ayuda de los hongos micorrízicos MA inoculados por nosotros.
Actualmente se está analizando los tejidos de raíz para análisis de metales pesados (Pb, Ca, Cd, Cr, Al).

RESULTADOS

Parte de los resultados obtenidos en el presente estudio, lamentablemente solo puede ser expuesto uno por contratos legales con la SENESCYT.

I: Caracterización molecular (Secuenciación, Filogenia) de las especies de MA provenientes de suelos ecológicamente contaminados.

Estos resultados filogenéticos no pueden ser todavía revelados por acuerdos legales con la SENESCYT al ser un proyecto que todavía debe cumplir con un mes de duración, está prohibido su exposición antes del período establecido.

II: Medición de concentración de MA en las raíces de las plantas obtenidas.

Las muestras de suelo y de raíces fueron recolectadas en dos sectores: Chinapintza y La Pangui, ambos pertenecientes a Zamora Chinchipe, se sabe que el suelo de Chinapintza está contaminado por pequeñas actividades mineras, mientras que la de El Pangui que queda a 5Km de Chinapintza, es un sitio naturalmente contaminado.
Los resultados por parte de un análisis del departamento de química de la UTPL para los principales metales pesados encontrados en las raíces las plantas obtenidas en ambas localidades, fueron en su mayoría de: Al, Cd, Cr, Cu, Pb y Zn. La tabla 1 muestra sus valores.

III: Análisis de metales pesados por medio de tejido de raíces provenientes de cosecha en invernadero.
Estos valores aún están siendo investigados por el departamento de química de la UTPL y sus resultados no pueden ser todavía expuestos al ser un proyecto vinculado con la SENESCYT que todavía debe cumplir con un mes de duración.




Al
Cd
Cr
Cu
Pb
Zn
Chinapintza
7.922,37 ppm
4,25 ppm
8,05 ppm
42,35 ppm
829,4 ppm
172,82 ppm
La Pangui
7536.12 ppm
2,13 ppm
11,65 ppm
26,71 ppm
498,72 ppm
87,94 ppm
Tabla 1. Resultados del análisis químico para los metales pesados obtenidos de ambos sitios de estudio de Zamora Chinchipe.



DISCUSIÓN

En cuanto al análisis molecular para las raíces obtenidas, es bueno saber que aunque éstas contengan sobre todo material genético proveniente de la planta y solo poco material genético del hongo micorrízico, de todas formas aunque sea poca la cantidad, esta es la forma de trabajar en estos tipos de experimentos; muy poca cantidad de material genético del hongo micorrízico es lo suficiente para que sea amplificado y secuenciado luego.

Los resultados de investigación del objetivo II, demuestran claramente la absorción de metales pesados por parte de asociación hongo-planta es superior en el suelo de Chinapintza dado que esta es una zona industrializada.

En el objetivo de investigación III, Chinapintza fue el único sitio previsto para obtener suelo contaminado para usarlo en el experimento de invernadero, dado que es un suelo más contaminado que El Pangui.
Cuando se quiere detectar y medir la colonización micorrízica en raíces, un baño de agua a 90°C es apropiado para mantener bien las muestras.

CONCLUSIONES

Luego de que los resultados de este primer año se publiquen a finales de Agosto, dando respuesta a las incógnitas de ¿cuáles son las especies de MA presentes y que especie de planta asociada con MA absorbe más metales pesados?; Selvaraj Thangaswamy, al haber trabajado desde 1991 en Micorrizorremediación, explica que inclusive sabiendo esto, no es correcto y peor prudente declarar a partir de estos resultados, que el suelo de las dos localidades de Zamora Chinchipe podrían ser remediados en un intervalo de tres años o menos, sin importar que se requiera a una propagación masiva por ayuda humana de la especie que mejor se relacionó con el MA  y mayor metales absorbió en el invernadero.

La solución es que se necesitan más o menos dos o tres años de investigación a partir de los resultados de esta publicación, para que se comience a saber si en primer lugar hay un posible remedio al suelo altamente dañado por la industrialización y minería no controlada de aquellos sectores.

Por último, se sabe desde luego que ahora mismo, el suelo de Chinapintza es el suelo más contaminado en que mi tutor ha trabajado hasta el momento, y esto se debe posiblemente a la falta de iniciativa de medidas regulatorias y de penalización que se deben aplicar para los que están acabando con el suelo y por ende con la flora de estos dos sectores de Zamora Chinchipe.

REFERENCIAS
Giasson, P., Karam, A., & Jaouich, A. (2008). Arbuscular mycorrhizae and alleviation of soil stresses on plant growth. In Mycorrhizae: Sustainable agriculture and forestry (pp. 99-134). Springer Netherlands.

He, Z. L., Yang, X. E., & Stoffella, P. J. (2005). Trace elements in agroecosystems and impacts on the environment. Journal of Trace Elements in Medicine and Biology, 19(2), 125-140.

Jeffries, P., Gianinazzi, S., Perotto, S., Turnau, K., & Barea, J. M. (2003). The contribution of arbuscular mycorrhizal fungi in sustainable maintenance of plant health and soil fertility. Biology and fertility of soils,37(1), 1-16.

Olexa, T. J., Gentry, T. J., Hartel, P. G., Wolf, D. C., Fuhrmann, J. J., & Reynolds, C. M. (2000). Mycorrhizal colonization and microbial community structure in the rhizosphere of annual ryegrass grown in pyreneamended soils. International Journal of Phytoremediation, 2(3), 213-231.

Phillips, J. M., & Hayman, D. S. (1970). Improved procedures for clearing roots and staining parasitic and vesicular-arbuscular mycorrhizal fungi for rapid assessment of infection. Transactions of the British mycological Society, 55(1), 158-IN18.

Selvaraj, T., Padmanabhan, C., JEONG, Y. J., & KIM, H. (2004). Occurrence of vesicular-arbuscular mycorrhizal (VAM) fungi and their effect on plant growth in endangered vegetations. Journal of microbiology and biotechnology, 14(4), 885-890.

Selvaraj, T., & Chellappan, P. (2006). Arbuscular mycorrhizae: a diverse personality. Journal of Central European Agriculture, 7(2), 349-358.


Wang, B., & Qiu, Y. L. (2006). Phylogenetic distribution and evolution of mycorrhizas in land plants. Mycorrhiza, 16(5), 299-363.

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